WCR版本开放获取的阿拉比卡咖啡基因数据库

世界咖啡研究(WCR)已经宣布释放的阿拉比卡咖啡基因指纹数据库,将各种身份验证更便宜、更简单。验证的咖啡品种是重要的,以确保质量控制植物材料提供给全球农民。该组织正在公开数据库访问科学界,这样就可以将由公共和私人实验室用于各种验证。

数据库最重要的应用之一是低成本的发展各种认证支持咖啡种子行业发展。类似的工具被广泛应用于其他作物种子生产者、种子交易员和食品制造商,但直到现在,这些工具已经太贵或者不使用咖啡在宽范围内。之前的研究通过WCR证实需要工具来支持更好的质量控制种子很多苗圃;发表的一项研究发现,只有61%的测试树基因符合(即39%不符合预期的基因档案品种)。这对于一个农民有灾难性的经济后果,如果,例如,一个抗病品种是容易使人衰弱的感染。

“这独特的成就给咖啡带来了新的技术大大降低质量控制成本,确保咖啡的未来农业,”詹妮弗博士说“佛恩”长,世界咖啡研究公司的首席执行官。“我们有极大的热情对这个新的全球咖啡行业公益事业,并鼓励在咖啡行业广泛吸收演员参与种植新的树木,不资助者实现者种植者的公共机构。”

确定的特定种类的基因组成,也被称为的“基因”是重要的很多步骤农业供应链。这个数据库的基因指纹阿拉比卡使用45单核苷酸多态性(SNP)分子标记-微小的基因变异分散通过植物的DNA序列创建一个独特的遗传指纹23最普遍认可的商业咖啡咖啡品种生产在拉丁美洲。SNP标记是准确的,可以快速分析和更低的成本比其他遗传标记。参考数据库被世界咖啡研究验证和改进使用超过30000叶树在六个国家样本(危地马拉、洪都拉斯、萨尔瓦多、尼加拉瓜、哥斯达黎加、和秘鲁)在2021年和2023年之间。数据库是一个生活文档:WCR计划增加指纹额外的品种在未来几个月和年。

确保咖啡社区直接访问这个服务,WCR曾与瑞典天祥集团艾瑞泰克验证和完善的数据库和技术协议,以便标记可用于高容量应用程序(通常,至少376个样本)。天祥集团艾瑞泰克是一个iso评定资格的质量保证实验室提供实验室服务的全球农业部门。现在WCR公开数据库也可以使用其他供应商开发自己的DNA测试服务。

作为一个例子,它是如何工作的,一个咖啡种子很多老板可能要检查他们的树木的遗传纯度,以确保它们是正确的。他们收集小片的树叶从树上他们想进行身份验证和发送他们的基因实验室。从叶中提取DNA样品,和苏格兰民族党是阅读。样本的SNP对已知的SNP指纹指纹进行比较的各种问题。指纹匹配时,各种可以证实。

协作和透明度,确保高质量植物为农民

数据库是由WCR育种团队,由Jorge Berny和桑托斯博士巴雷拉(WCR研究科学家,植物育种和基因组学)基础上标记面板由大鹏Zhang博士从美国农业部农业研究所(研究遗传学家)。多个机构促进访问叶样品用于创建和验证数据库,中心包括CATIE, ICAFE, IHCAFE ANACAFE。这项工作是由WCR成员公司和美国农业部/ FAS摩卡咖啡的程序。

这个公共参考面板SNP-based遗传标记作为一个至关重要的工具,一个飞跃咖啡行业认证的品种,降低风险,提高农民的价值。

这样的工具可以产生重大影响的一个例子对咖啡的生产规模可以在萨尔瓦多。萨尔瓦多政府正在进行一个全国性的改造计划,生产和分配的目标超过1.5亿种植物在未来十年的承诺重振中国咖啡行业。这些植物是希望生成1.8 -200万袋(45.6公斤)的出口绿色咖啡,刺激该国经济和支持全国生产商的生计。这个SNP面板被用于验证的真实性树计划分配给农民,以确保它们是高性能的品种选择满足该国雄心勃勃的生产目标。WCR兴奋是合作伙伴在这个工作来维持高品质咖啡豆的供应从萨尔瓦多。

访问SNP数据库,点击这里。基因检测服务的访问,访问天祥集团艾瑞泰克

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